Bandeau Otolithe mulet
Laboratoire de sclérochronologie.

Laboratoire de sclérochronologie.

Détermination des traits d'histoire de vie des poissons pour l'étude du comportement et de son influence sur le fonctionnement et l'évolution des populations naturelles

La sclérochronologie regroupe les techniques qui permettent de déterminer les traits d’histoire de vie des poissons en utilisant des pièces calcifiées prélevées sur ou dans leur corps. L'interprétation de ces échantillons permet l’étude du comportement des animaux et son influence sur le fonctionnement et l’évolution des populations naturelles.

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Les pièces calcifiées utilisées et étudiées au sein de l'ISC ECP sont : les écailles (prélevées sur poissons anesthésiés), les otolithes ou les vertèbres (sur des animaux morts).

Vertèbre de saumon. On aperçoit les circulis de croissance qui permettront la détermination de l'âge du poisson, entre autre.
Vertèbre de saumon. On aperçoit les circulis de croissance qui permettront la détermination de l'âge du poisson, entre autre. © INRAE-GLISE

 

Les extractions et le conditionnement de ces pièces se font sur le terrain ou en laboratoire. Elles sont sélectionnées puis préparées pour leur lecture et interprétation.

Diverses techniques sont mises en œuvre :

  • Création et interprétation d’image (numérisation d’écailles, lecture, image en fluorescence, mesures, morphométrie)
  • Marquage de pièces calcifiées par choc thermique ou marqueurs chimique (alizarine, fluorescéine…)
  • Analyses microchimiques élémentaires ou isotopiques en collaboration avec d’autres laboratoires.
  • Analyses et interprétation de données (statistiques) pour la mise au jour des traits de vie.
Vue à la loupe binoculaire d'un otolithe d'anguille après préparation.
Vue à la loupe binoculaire d'un otolithe d'anguille après préparation. © INRAE-GLISE

 

Diverses méthodes sont mises en œuvre pour :

  • L’étude des stries de croissance (annuli) sur écaille et otolithe pour l’estimation de l’âge individuel.
  • L’étude des zones d’érosion de l’écaille pour la détermination des évènements de reproduction.
  • L’étude des circuli de l’écaille et microchimie de l’otolithe pour la détermination des évènements de changement de milieu de vie.
  • L’étude de la croissance de l’écaille et de l’otolithe pour la modélisation de la croissance somatique et les rétrocalculs de taille.
  • L’étude de la microchimie de l’otolithe (collaboration IPREM) pour la détermination de nombreux traits de vie.
Civelle (juvénile d'anguille) marquée par balnéation à la calcéïne.
Civelle (juvénile d'anguille) marquée par balnéation à la calcéïne. © INRAE-GLISE

 

Divers outils sont utilisés pour ces travaux :

  • Microscope photonique motorisé XYZ et illumination par flurorescence, logiciel d’analyse TNPC (collaboration IFREMER).
  • Loupes binoculaires et illumination par fluorescence, logiciels d’analyse d’image (Cell A, Olympus)
  • Lecteur de microfiche et scanner (numérisation).
  • Microscope de contrôle pour la préparation et le ponçage de otolithes.
  • Polisseuse et tronçonneuse de précision.
  • Étuve à convection, sorbonne.
  • Salles sécurisées spécifiques dédiées à l’archivage et conservation des échantillons
Coupe transversale d'un bloc de résine contenant un otolithe d'anguille à l'aide d'une tronçonneuse à fil diamant.
Coupe transversale d'un bloc de résine contenant un otolithe d'anguille à l'aide d'une tronçonneuse à fil diamant. © INRAE-GLISE

 

 

D'après le site internet du CRB COLISA:

› CRB COLISA

"Labellisée Centre de Ressources Biologiques (CRB) par le GIS IBISA en décembre 2017 et certifiée ISO 9001:2015 depuis juillet 2020, la collection d'échantillons ichtyologiques résulte de la fusion d'échantillons historiques et récents provenant de nombreux spécimens aquatiques, collectés par l'U3E et DECOD à Rennes, l’UMR ECOBIOP à Saint Pée sur Nivelle, l’UMR CARRTEL à Thonon les Bains (SOERE OLA) et l'OFB

COLISA fait partie du BRC4Env, le réseau des Centres de Ressources Biologiques pour l'Environnement qui a pour but de stocker et fournir des ressources environnementales (matériel biologique et données associées), de manière sécurisée et avec une traçabilité optimale.

Le BRC4Env est l'un des piliers constitutifs de l'infrastructure nationale française "Ressources Agronomique pour la Recherche" (AgroBRC-RARe) qui rassemble cinq réseaux de CRB.

Cette collection se caractérise par son envergure historique (plus de 46 ans), par la nature et la quantité des échantillons ainsi que par leur origine géographique (territoire national)."

Atelier de scalimétrie et armoires sécurisées contenant les collections répertoriées COLISA.
Atelier de scalimétrie et armoires sécurisées contenant les collections répertoriées COLISA. © INRAE-GLISE